一直以来，我们都认为肝肠胞虫主要来源于苗场，但也不完全是这样。因为，肝肠胞虫的主要传播方式为：水平传播和垂直传播，即肝肠孢虫可以通过受精卵和虾苗垂直传播，也可以通过感染养殖水体、摄食病虾等水平传播。

而在水平传播当中，底泥中难以清除的肝肠胞虫，是造成对虾大面积感染的元凶。在检测肝肠胞虫含量时，我们往往会重视虾体的肝肠胞虫检测，往往会忽视底泥。要知道，活虾有检出肝肠胞虫的话，底泥中基本上也都会检出。

因此，要有效防控肝肠胞虫，就要切断水平和垂直传播，重视底泥中的肝肠胞虫，具体请往下看。

养殖20天以内，肝肠胞虫经过两次抽样检测均大于10³copies/(ng Hp DNA)时，建议尽快采取以下措施：

1、补充各种维生素、多糖，可以从一定程度上提高对虾免疫力，让对虾有足够的体质来对抗肝肠胞虫的感染；

2、内服驱虫产品，一方面抑制虾肝肠孢虫继续生长，另一方面防止感染后的继发性细菌感染；

3、增加排污的频次，及时清理底部粪便，将粪便携带孢子虫卵囊传播的风险降到最低；

4、感染过虾肝肠孢虫的虾塘，在清塘的时候需用生石灰、烧碱进行池体消毒，使用氯制剂或者高锰酸钾并不能有效杀灭虾肝肠胞虫；

5、上一造虾感染过肝肠胞虫，建议彻底清塘消毒后，下一造转养鱼，一年后再转养虾，可以大大的降低肝肠胞虫的发病率。

肝肠孢虫还是本着早发现、早检测、早处理的原则，如果在后期，肝肠孢虫会大面积破坏虾的肝胰腺和肠道上皮细胞，此时处理就为时已晚。